牙签的正确历史至今仍无定论，但考古学家曾在史前人的牙齿中发现类似使用牙签的凹痕，亦曾在牙缝间发现小竹签的残余。在美国，第一个使用牙签的是一家在麻州波士顿的海鲜餐厅“联合牡蛎屋”Union Oyster House，发明牙签的企业家在当时很明显的企图以哈佛学生作为最佳客户，甚至于付钱让哈佛学生在该餐厅吃饭，只为了让他们试用牙签。

牙签亦称“剔牙棒”等等，就是一端或两端削尖的木签、竹签、玉米或塑料棒和塑料牙线，也有使用某些动物如象牙或鱼的特殊骨头，用来剔除牙垢或牙缝中杂物的木质或竹质细棍，也有合成材料的牙签(比如瑞士军刀)，它是一种重要的口腔卫生用具，它已经有超过2000年的历史了。英文：toothpick。

其实这种即用即弃的东西是源自印度的，有人认为它可能与佛祖释迦牟尼给弟子们传授卫生有关。牙签与牙刷在早期都被称为“杨枝”，起源于印度。

传说佛祖释迦牟尼向弟子们讲道时，发现围在他四周的弟子们，在开口说话时都有口臭的毛病，于是释迦牟尼给他们另外教授了卫生课。他说：“汝等用树枝刷牙，可除口臭，增加味觉，可得五利也。”释迦牟尼当时在菩提树下弘扬佛法，顺便教导弟子们消除口臭的方法。至今，印度的劳苦大众，在早上仍会以树枝或木片刷牙和剔牙，大概与此传说有关。由此推算，早在二千年前，印度人已经懂得用树枝或木片，当作牙刷来清洁口腔。后来，印度人这种用树枝来消除口臭的秘方，随着到访的佛教僧人传入了中国。

今日由于环保意识的提升，牙签制造商渐渐的不用木头来制作牙签，而是使用一些可食用或可分解的材料来制作。如淀粉性塑料等。中国有些牙签是用竹子做的。过去中国皇室所用的牙签有些甚至是象牙做的。牙签与牙签包装也是某些收藏家的特殊喜好。此外，亚洲使用的牙签往往比欧美使用的牙签要来的尖细。

有一点要注意的是，中国古诗中有提到牙签者，往往是指象“牙”做的书“签”，而非剔牙用的牙签。

在夏威夷，曾有一家中餐馆因为一位老太太用牙签剔牙出血，被法官判定没有以书面注明使用牙签的方法和危险而赔偿数百万。因此在美国的牙签盒上都注明牙签的使用方法和使用不当的危险性。

观点一

牙签其实是一种重要的口腔卫生用具，它已经有超过2000年的历史了。由于它的体积细小，制作的材料通常是木材或竹子，而且也很容易被化为灰烬，因此它的地位低微，历史上也确实很少留下关于牙签发明的证据。幸而，中国的考古学家发掘出以黄金打制而成的牙签，制作的年代大概在汉末时期。这种黄金牙签虽然属于少数的皇族，而非平常百姓所拥有的，但依然可证明公元3世纪中国已有牙签了。
观点二

一直以来，人们有一种错觉，就是将筷子与牙签同样视为是中国人的发明品。因为一般人以为，中国人一向讲究饮食，在饮食文化发达的中国，既然有人发明了筷子这种实用品，那么与它相关的用品牙签，也理所当然地同时被发明出来。但是事实却并非如此。
至今，印度的低收入者，用牙签当作牙刷来清洁口腔。后来，印度人用树枝来消除口臭的秘诀，随着到访的佛教僧人传入了中国。于是，他们就地取材多用杨柳作齿刷工具，因此从印度文翻译成汉语就写成了“杨枝”。现代汉语已经不再用“杨枝”一词，而只有日本仍是源用这个古词。